外語學院自1986年恢復建系以來, 與國外多所高校及學術機構建立了良好的交流與合作關系, 其中與美國英語協會、英國文化委員會、日本愛知工業大學、英國麥克米倫出版公司在師資培養、教材開發等方面的交流合作已取得令人滿意的成果。自1989年起, 外語系共派遣教師數十余人次到美國的Elon大學、英國、新加坡、印度等國內外大學作學術文化交流、講學和進修。這既培養鍛煉了師資隊伍, 又拓寬了與國內外院校交流與合作的渠道, 為擴大東南大學的國際影響和學術知名度, 做出了可喜的成績。

外語學院開辟多樣化的辦學形式, 嘗試與國外高校聯合辦學, 以推動我系外語教育事業的改革與發展, 促進我系外語學科和專業的建設與發展, 提高外語教師學歷與專業水準, 取得了初步的成績。2003年7至9月, 根據東南大學外語學院與英國坎特伯雷基督大學學院語言研究系聯合辦學的協議, 東南大學外語學院首批應用語言學碩士研究生及教師18人赴英國坎特伯雷基督大學學院學習, 獲得圓滿成功。2003年, 東南大學外語學院與澳大利亞悉尼大學同意以聯合辦學的形式, 合作培養TESOL / 語言方向教育學碩士研究生, 為促進我國外語教師隊伍的建設做出了貢獻, 這也是東南大學進一步與國際高校合作, 積極推進教育國際化的有益嘗試。

此外, 東南大學外語學院與日本大東文化大學、日本和光大學籌劃校際交流的項目， 互相派遣學生和教員，并開展漢日語言文化課題的合作研究。