廣州大學城位于廣州東南部，選址番禺小谷圍島，西鄰洛溪島、北鄰生物島、東鄰長洲島，與琶洲島舉目相望。小谷圍島面積17.9平方公里，是世界上少有的島嶼大學用地，為象牙塔提供了一處天然的世外桃源。

廣州規劃院副院長葉青博士談大學城選址：廣州大學城所在的位置在整個大廣州都會區實際上是一個中心的區域，當初為什么選擇小谷圍島，主要是因為小谷圍島擁有獨特的生態環境、自然環境。第二個就是在交通方面是離市區是最近的，同時它有一個相對獨立和空闊的用地，這個是硬性條件。

實際上我們有一個選址的原始的驅動力，整個廣州市的城市發展都是沿著珠江水道由西往東再往南發展，大學城的選址應運廣州市發展的方向，所以選址在小谷圍島表面上看是偶然因素，實際上有一些必然性在里面。這一點在公開性的文件沒有這樣提過，但是接下來大學城再往下發展，廣州新城、廣州南沙地區都是沿著珠江水道發展，所以選址小谷圍島是一個必然的結果。

位于珠江江心的小谷圍島，自古以來就是風水勝地。不僅從形狀上看，神似一只富有靈性的神龜，守護著珠江水域的出海口，作為廣州風水大局的水口辰星，這只u201c神龜u201d，其與珠江三塔一起，構成了粵府文昌風水格局。小谷圍島在風水布局上文昌之位尤為突出，其東南巽位正是u201c廣州文昌位u201d。這里先后有郭塱私塾、官山書院等桃李滿天下的古代學堂，人文歷史底蘊深厚，周邊亦有多個近代史上較為重要的歷史遺存，是名副其實的歷史人文中心。政府投入300億的巨資建設大學城，意在將此人文淵源一脈相承。

內環全長4.2公里、中環全長11.1公里、外環全長14.9公里。