學院擁有農林經濟管理博士點一級學科和博士后科研工作流動站；農業經濟管理、林業經濟管理、農業商務管理、水利經濟管理4個二級學科博士點；有農林經濟管理、應用經濟學2個碩士點一級學科，農業經濟管理、林業經濟管理、農業商務管理、水利經濟管理、區域經濟學、財政學、金融學、產業經濟學、國際貿易學、勞動經濟學、統計學、數量經濟學、國民經濟學等13個二級學科碩士點，有農業推廣碩士（兩個領域）和公共管理（MPA）2個專業學位碩士點。農業經濟管理已成為自治區重點學科。 　　學院設有干旱區農村發展研究中心、中亞農業合作與貿易研究中心、新疆農業特色產業發展研究中心和旅游規劃與設計研究所四個學科平臺。干旱區農村發展研究中心已成為自治區人文社科重點研究基地。 　　學院有農林經濟管理、經濟學、市場營銷、國際經濟與貿易、會計學、旅游管理六個本科專業，并開展了雙學位教育。