根據上述職責，市商務局設8個內設機構：

（一）辦公室

綜合協調局機關及直屬單位工作，督促重大事項的落實；負責重要會議的組織及會議決定事項和市委、市政府督辦件和人大、政協建議、提案的督辦與反饋；負責局機關文電、政務信息、機要、保密、信訪、檔案、接待、車輛管理和效能建設等工作；承擔政務信息、政府信息公開、辦公自動化和其他行政后勤工作；負責機關及直屬單位機構編制、人事勞動和離退休人員管理工作；負責指導國有糧食購銷企業離退休人員的管理和服務、勞動工資管理以及系統機構、人員、工資統計工作。

（二）計劃財務科（內部審計室）

負責編報全市商務中長期發展規劃，制定全市商務年度考核工作指標體系，參與考核全市各單位外經貿工作；負責監測分析商務宏觀運行狀況，承擔有關商務統計及信息發布工作，提供信息咨詢服務；貫徹落實有關外經貿的財稅、金融、外匯、保險、價格等政策，擬訂并組織實施全市促進商務發展的政策措施；管理商務發展基金、擔保基金、中小企業國際市場開拓資金、出口專項貸款、商務獎勵經費等各項業務資金，承擔由市商務局負責安排的各類資金的具體使用和管理工作；協調財貿、稅貿、銀貿、匯貿、信貿等合作。

組織實施國家有關糧食財務、會計管理的政策；負責各種政策性補貼、費用資金的撥付及使用監管，配合有關部門落實糧食風險基金管理；指導、監督國有糧食企業的財務管理、會計核算和會計報表、財務分析的編制；負責局機關財務、資產管理、行政經費預算編制、會計核算及行政經費的收支；執行經費預決算制度及各項財務制度；負責國有糧食企業的內部審計工作；負責指導糧食系統增收節支和國有資產管理工作。

（三）流通業與市場秩序科

負責流通行業管理、促進等發展工作，承擔流通業發展規劃擬訂與組織實施、流通行業統計、行業標準推行、行業科技進步工作；負責我市國內貿易的動態跟蹤和研究分析工作，牽頭研究制定內貿促進政策并監督實施；提出深化流通體制改革的政策措施，會同有關部門擬定并組織實施現代物流產業發展戰略和規劃；負責物流業發展調控，整合公共物流信息平臺，提高物流信息化水平；組織推進連鎖經營、商業特許經營等現代流通方式的發展，承擔拍賣、舊貨流通和再生資源流通等特殊流通行業監管工作；負責指導商業體系建設和商貿行業文明建設；負責組織開展商務領域綜合行政執法，牽頭協調打擊侵權和假冒偽劣商品，協調打破市場壟斷、行業壟斷和地區封鎖的相關工作，牽頭規范零售企業促銷行為，促進零售商供應商公平交易；協調管理我市商品貿易經營秩序，負責國際品牌保護，組織協調與貿易有關的知識產權保護應對事項，推動建立和完善多雙邊執法合作機制；推動商務領域信用建設、信用擔保、商業擔保工作。

（四）市場體系建設與市場運行科（電子商務發展科）

負責市場體系建設和城鄉市場發展促進工作，擬訂引導資金投向市場體系建設的政策措施，組織實施市場體系建設重大投資項目；指導城市商業網點規劃制定與實施、大宗產品批發市場和社區商業建設，推進農村市場體系建設和改造升級；指導汽車、建材、農機等工業品流通服務體系建設，承擔汽車流通行業監督管理、報廢汽車監督管理和老舊汽車更新工作。

負責商品市場運行調控和商務領域消費促進工作；擬訂并組織實施商品市場運行調節的政策；負責市場運行、商品供求的監測預警和信息引導；負責建立健全生活必需品市場供應應急管理機制；負責組織實施重要消費品市場調控和重要生產資料流通管理，組織實施重要商品（肉、糖、蛋、菜等）市場調控、儲備管理和應急商品調控；負責協調副食品生產供應工作，指導管理u201c菜籃子u201d商品流通和城市副食品基地建設；按有關規定監督管理酒類流通、原油和成品油流通；統籌商務領域消費促進工作。

制訂全市電子商務開拓市場規劃、商務領域信息化建設規劃，擬訂并組織實施扶持電子商務發展的政策措施和電子商務的相關標準、規范，建立適應電子商務快速發展的管理體制，完善跨部門電子商務工作協作機制，建立電子商務公共服務體系和信用體系，開展電子商務統計監測和分析；拓展電子商務應用，重點推進網絡零售、跨境貿易和生活服務領域電子貿易；負責電子商務示范體系建設，負責推動電子商務平臺、產業園區、示范企業、基地和城市建設；指導商務領域電子政務工作，組織商務領域信息化的培訓與交流。

（五）對外貿易和對外經濟合作科

指導和管理全市對外貿易工作，參與擬訂全市外貿中長期發展規劃和年度計劃；承擔全市涉及世貿組織事務的綜合協調、指導和服務工作；承擔協調我市有關進出口公平貿易的具體工作，建立進出口公平貿易預警機制；依法負責國際貿易摩擦應對，指導、協調外國對我市出口商品的反傾銷、反補貼、保障措施和特殊保障措施的應訴及相關工作；負責我市舉辦或參與的境內外國際性展覽會等貿易促進有關工作，組織實施我市出口品牌體系建設，協調指導企業開拓國際市場；負責管理全市加工貿易，研究擬訂全市對外加工裝配發展規劃和年度計劃；負責市直單位對外加工裝配合同的審批；指導協調管理全市對外加工裝配業務；負責管理全市服務貿易，擬訂全市服務貿易發展規劃與年度計劃，推動服務外包發展和平臺建設；負責全市技術進出口管理工作；協調全市對臺小額貿易管理；指導重點商品出口基地建設；協調管理全市商品進出口經營秩序；聯系、協調外貿有關行業協會、商會工作；管理外地在本市設立的商務辦事機構。負責全市對外經濟合作工作；參與我市對外投資業務及對外投資統計分析工作；負責管理全市對外勞務合作、對外承包工程工作；協調管理境外投資企業；協調對臺港澳經貿工作；協調管理全市接受國際多雙邊援助工作和對外經濟援助項目的實施工作；依法承擔對外勞務合作、境外就業、對外承包工程和對外援助的權益保護和監督管理工作，服務和管理我市對外勞務派出機構，參與協調處理有關境外勞務、就業的突發事件。

（六）投資促進管理科

指導和管理全市招商引資和投資促進工作；參與擬訂全市吸收外商投資的中長期發展規劃和年度計劃，貫徹執行《外商投資產業指導目錄》；負責外資管理相關工作，協調解決有關問題；配合有關部門組織全市外商投資企業的聯合年報工作，負責編制并組織實施全市招商引資方案，組織承辦全市性重大招商活動；對重大招商項目進行跟蹤和促進；負責外資統計工作；協調指導全市外商投資的咨詢服務工作；負責指導管理全市對臺港澳投資促進工作，協調處理有關重大問題；指導開發區招商引資工作，監測分析開發區運行情況，負責開發區有關統計工作；與境外國際投資機構、商協會建立投資促進合作關系。承擔市外資領導小組日常工作。

（七）糧食科

研究提出全市糧食宏觀調控、總量平衡和糧食流通中長期規劃以及動用我市地方儲備糧的建議；負責制訂和組織實施全市糧食倉儲設施建設和改造的規劃；研究提出我市地方儲備糧的規模、布局、品種結構的建議；負責糧食倉庫、流通設施建設和改造資金的籌措及使用管理；編制和組織實施儲備糧年度輪換計劃；組織實施福建省糧食流通統計制度；負責糧食流通統計和糧油供需平衡調查工作；負責全市地方儲備糧油的倉儲管理工作；負責應急時期糧油市場調控。

制定全市糧油市場管理制度；負責糧食收購資格審核及骨干糧店、加工企業管理工作；組織糧食收購，落實惠農政策；指導國有糧食企業改革和經營管理工作；落實糧食產銷協作工作；承擔軍糧供應保障工作；負責糧食市場監測預警；擬訂糧食安全應急預警預案并組織實施；協調救災救濟和重要節日的糧食供應；核定本行政區域內糧食批發、加工企業、連鎖超市等糧食經營企業正常情況下的最低庫存及異常情況下最高庫存；承擔市人民政府糧食安全應急指揮部日常工作；負責糧食行業科技管理、新技術應用；指導糧油品牌建設、龍頭企業建設及糧食種植基地建設；負責對糧食收購環節的糧食質量安全和原糧衛生進行監管。依法對糧食經營者從事糧食收購、儲存、運輸活動和政策性用糧的購銷活動及執行國家糧食流通統計制度的情況進行監督檢查；依法對市儲備糧的數量、質量、儲存安全以及輪換計劃執行情況及儲備糧承儲企業的資格進行監督檢查；負責糧食收購資格、骨干糧食加工企業及骨干糧店資格的核準；開展糧食流通監督檢查工作；指導糧食行業法制建設，聯系、協調市糧油行業協會。

（八）政策法規科（行政審核審批科）

擬訂我市商務發展戰略、中長期規劃和推進商務體制改革的措施，研究商務運行和結構調整中的重大問題并提出相關政策建議；起草并組織實施我市有關經濟貿易發展的規范性文件。貫徹上級關于流通行業管理、市場秩序、電子商務、利用外資、對外貿易和對外經濟技術合作的法律法規和政策規定；負責本局規范性文件合法性審核；承擔商務領域法律法規宣傳工作；負責辦理行政復議、行政訴訟、應訴和行政賠償案件及機關普法、依法行政等工作；配合有關部門參與重大經貿協議、合同、章程和重大爭議案件的研究與協調；負責組織重要課題調研工作；負責綜合性材料和政策性文件的起草工作；負責對全市商務領域的安全生產檢查、督促，組織檢查全市糧油實物庫存和儲糧安全工作。負責行政審批事項的審核、核準、審批、備案、轉報及相關政策咨詢工作；負責駐行政服務中心窗口管理和建設工作，以及行政審批制度改革工作和制定行政審批管理工作制度。

機關黨組織根據《中國共產黨章程》、《中國共產黨和國家機關基層組織工作條例》的有關規定設置。