第一階段:起步營運階段(1993-1994年)本階段的主要任務是: 完成全區海關隔離設施及u201c七通一平u201d基礎設施建設,部分倉庫、寫字樓、商品貿易展示街、 臨時碼頭等公用及商用建筑物建成并投入使用,形成高標準的投資經營環境; 倉儲區及金融貿易區的建設全面鋪開;打通國內外招商渠道,大規模進行項目引進; 主要政策落實到位,內外部體制關系基本理順;建立一個集中、精簡、高效、廉潔的行政管理體系; 服務體系基本形成,為全區提供全面優質服務。
第二階段:功能發揮階段(1995-1996年)本階段的主要任務是:繼續完成部分倉庫、 寫字樓的建設,使大部分規劃建設項目竣工;重點發揮國際貿易功能、商品櫥窗功能, 使之形成廣州保稅區的重要特色;其它各項功能開始發揮,形成基本架構;汽車、 生產資料、高檔日用品、電子產品、金銀首飾等一批有形專業市場建成營運,并具備國際化、 規范化的管理水平;管理機構的運作趨于成熟,主要政策以立法形式加以確定。
第三階段:功能完善階段(1997- )本階段的主要任務是完善各項功能,使保稅區整體功能得以發揮; 以組合方式擴大保稅區地域面積。這個階段,全區一片繁榮,內外客商云集, 貨物集散規模大,經濟效益顯著, 一個高度開放的符合國際標準的綜合性自由貿易區崛起在黃埔港區,構成廣州國際化大都市的一個重要組成部分, 成為廣州經濟國際化的重要標志之一。