在報關時，全部報關單必須交驗，法定單證和商業單證只需交驗與該批進出口貨物有關管理規定的相關單證，即不必全部交驗。對貨物的查驗主要是通過核對實際進出貨物與報關單證內容是否一致，為征稅、統計和后續管理提供可靠的監管依據。

海關查驗貨物采取徹底查驗、抽查和外形查驗三種方式。目前在國際貿易巨量化時代，元論采用何種技術手段也不可能逐一對貨物進行徹底查驗，一般是采用抽查。并且抽查比例較低。海關抽查比例是根據進出口企業和特定商品的檔案記錄隨機確定。