1、倉庫管理。確定專門人員負責加工貿易倉庫管理，實時記錄倉庫進出口情況。專門倉庫堆放保稅貨物或單獨堆放保稅貨物(包括原料和成品、半成品)，不得與國內原料混在一起。 　2、完善生產管理，詳細記錄加工貿易生產情況。企業生產按工序每日(第班次)詳細記錄領料(同品種原料)串換、混合生產。

　3、建立完整的加工貿易合同檔案。

　各企業必須對加工貿易合同執行情況建立完整的檔案。內容包括：進出口合同、函電、海關備案、核銷情況、生產記錄等。