其一是許多結點有同有異，難以明確區別；
　其二是各種結點尚在發展過程中，其功能、作用、結構、工藝等尚在探索，使分類難以明朗化。

試按結點的主要功能分類如下： 
　在各個物流系統中，結點都起著若干作用，但隨整個系統目標不同以及結點在網絡中的地位不同，結點的主要作用往往不同，根據這主要作用可分成以下幾類： 
　1．轉運型結點。
　以接連不同運輸方式為主要職能的結點；鐵道運輸線上的貨站、編組站、車站，不同運輸方式之間的轉運站、終點站，水運線上的港口、碼頭，空運中的空港等都屬于此類結點。一般而言，由于這種結點處于運輸線上，又以轉運為主，所以貨物在這種結點上停滯的時間較短。
　2．儲存型結點。以存放貨物為主要職能的結點，貨物在這種結點上停滯時間較長。在物流系統中，儲備倉庫、營業倉庫、中轉倉庫、貨棧等都是屬于此種類型的結點。
　盡管不少發達國家倉庫職能在近代發生了大幅度的變化，一大部分倉庫轉化成不以儲備為主要職能的流通倉庫甚至流通中心，但是，在現代世界上任何一個有一定經濟規模的國家，為了保證國民經濟的正常運行，保證企業經營的正常開展，保證市場的流轉，以倉庫為儲備的形式仍是不可缺乏的，總還是有一大批倉庫仍會以儲備為主要職能。在我國，這種類型的倉庫還占主要成分。
　3．流通型結點。以組織物資在系統中運動為主要職能的結點，在社會系統中則是組織物資流通為主要職能的結點。現代物流中常提到的流通倉庫、流通中心、配送中心就屬于這類結點。
需要說明的是，在各種以主要功能分類的結點中，都可以承擔著其他職能而不完全排除其他職能。如轉運型結點中，往往設置有儲存貨物的貨場或站庫，從而具有一定的儲存功能，但是，由于其所處的位置，其主要職能是轉運，所以按這主要功能歸人到轉運型結點之中。
　4．綜合性結點。在物流系統中集中于一個結點中全面實現兩種以上主要功能，并且在結點中并非獨立完成各自功能，而是將若干功能有機結合于一體，有完善設施、有效銜接和諧調工藝的集約型結點。這種結點是適應物流大量化和復雜化，適應物流更為精密準確，在一個接點中要求實現多種轉化而使物流系統簡化、高效的要求出現的，是現代物流系統中結點發展的方向之一。