2008年3月21日《國(guó)務(wù)院關(guān)于機(jī)構(gòu)設(shè)置的通知》規(guī)定部門(mén)設(shè)置如下:

國(guó)務(wù)院設(shè)置辦公廳、國(guó)務(wù)院組成部門(mén)（27個(gè)）、國(guó)務(wù)院直屬特設(shè)機(jī)構(gòu)（1個(gè)）、國(guó)務(wù)院直屬機(jī)構(gòu)（16個(gè)）、國(guó)務(wù)院辦事機(jī)構(gòu)（4個(gè)）、國(guó)務(wù)院直屬事業(yè)單位（17個(gè)）、國(guó)務(wù)院部委管理的國(guó)家局（22個(gè)）、國(guó)務(wù)院議事協(xié)調(diào)機(jī)構(gòu)（33個(gè)）。

2013年3月10日,國(guó)務(wù)院機(jī)構(gòu)改革和職能轉(zhuǎn)變方案公布。這次改革，國(guó)務(wù)院正部級(jí)機(jī)構(gòu)減少4個(gè)，其中組成部門(mén)減少2個(gè)，副部級(jí)機(jī)構(gòu)增減相抵?jǐn)?shù)量不變。改革后，除國(guó)務(wù)院辦公廳外，國(guó)務(wù)院設(shè)置組成部門(mén)由2008年的27個(gè)變?yōu)?5個(gè)。

2018年3月13日，國(guó)務(wù)院機(jī)構(gòu)改革方案公布，根據(jù)該方案，改革后，國(guó)務(wù)院正部級(jí)機(jī)構(gòu)減少8個(gè)，副部級(jí)機(jī)構(gòu)減少7個(gè)，除國(guó)務(wù)院辦公廳外，國(guó)務(wù)院設(shè)置組成部門(mén)26個(gè)。

中華人民共和國(guó)國(guó)務(wù)院辦公廳

中華人民共和國(guó)外交部

中華人民共和國(guó)國(guó)家發(fā)展和改革委員會(huì)

中華人民共和國(guó)科學(xué)技術(shù)部

中華人民共和國(guó)國(guó)家民族事務(wù)委員會(huì)

中華人民共和國(guó)國(guó)家安全部

中華人民共和國(guó)司法部

中華人民共和國(guó)人力資源和社會(huì)保障部

中華人民共和國(guó)生態(tài)環(huán)境部

中華人民共和國(guó)交通運(yùn)輸部

中華人民共和國(guó)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部

中華人民共和國(guó)文化和旅游部

中華人民共和國(guó)退役軍人事務(wù)部

中國(guó)人民銀行

中華人民共和國(guó)國(guó)防部

中華人民共和國(guó)教育部

中華人民共和國(guó)工業(yè)和信息化部

中華人民共和國(guó)公安部

中華人民共和國(guó)民政部

中華人民共和國(guó)財(cái)政部

中華人民共和國(guó)自然資源部

中華人民共和國(guó)住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部

中華人民共和國(guó)水利部

中華人民共和國(guó)商務(wù)部

中華人民共和國(guó)國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)

中華人民共和國(guó)應(yīng)急管理部

中華人民共和國(guó)審計(jì)署

教育部對(duì)外保留國(guó)家語(yǔ)言文字工作委員會(huì)牌子。科學(xué)技術(shù)部對(duì)外保留國(guó)家外國(guó)專家局牌子。工業(yè)和信息化部對(duì)外保留國(guó)家航天局、國(guó)家原子能機(jī)構(gòu)牌子。自然資源部對(duì)外保留國(guó)家海洋局牌子。生態(tài)環(huán)境部對(duì)外保留國(guó)家核安全局牌子。

國(guó)務(wù)院國(guó)有資產(chǎn)監(jiān)督管理委員會(huì)

中華人民共和國(guó)海關(guān)總署

國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局

國(guó)家體育總局

國(guó)家國(guó)際發(fā)展合作署

國(guó)務(wù)院參事室

國(guó)家稅務(wù)總局

國(guó)家廣播電視總局

國(guó)家統(tǒng)計(jì)局

國(guó)家醫(yī)療保障局

國(guó)家機(jī)關(guān)事務(wù)管理局

國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局對(duì)外保留國(guó)家認(rèn)證認(rèn)可監(jiān)督管理委員會(huì)、國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)化管理委員會(huì)牌子。國(guó)家新聞出版署（國(guó)家版權(quán)局）在中央宣傳部加掛牌子，由中央宣傳部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。國(guó)家宗教事務(wù)局在中央統(tǒng)戰(zhàn)部加掛牌子，由中央統(tǒng)戰(zhàn)部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。

國(guó)務(wù)院港澳事務(wù)辦公室

國(guó)務(wù)院研究室

國(guó)務(wù)院僑務(wù)辦公室在中央統(tǒng)戰(zhàn)部加掛牌子，由中央統(tǒng)戰(zhàn)部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。國(guó)務(wù)院臺(tái)灣事務(wù)辦公室與中共中央臺(tái)灣工作辦公室、國(guó)家互聯(lián)網(wǎng)信息辦公室與中央網(wǎng)絡(luò)安全和信息化委員會(huì)辦公室，一個(gè)機(jī)構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機(jī)構(gòu)序列。國(guó)務(wù)院新聞辦公室在中央宣傳部加掛牌子。

新華通訊社

中國(guó)社會(huì)科學(xué)院

國(guó)務(wù)院發(fā)展研究中心

中國(guó)氣象局

中國(guó)證券監(jiān)督管理委員會(huì)

中國(guó)科學(xué)院

中國(guó)工程院

中央廣播電視總臺(tái)

中國(guó)銀行保險(xiǎn)監(jiān)督管理委員會(huì)

國(guó)家行政學(xué)院與中央黨校，一個(gè)機(jī)構(gòu)兩塊牌子，作為黨中央直屬事業(yè)單位。

國(guó)家信訪局（由國(guó)務(wù)院辦公廳管理）

國(guó)家能源局（由國(guó)家發(fā)展和改革委員會(huì)管理）

國(guó)家煙草專賣(mài)局（由工業(yè)和信息化部管理）

國(guó)家林業(yè)和草原局（由自然資源部管理）

中國(guó)民用航空局（由交通運(yùn)輸部管理）

國(guó)家文物局（由文化和旅游部管理）

國(guó)家煤礦安全監(jiān)察局（由應(yīng)急管理部管理）

國(guó)家藥品監(jiān)督管理局（由國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局管理）

國(guó)家糧食和物資儲(chǔ)備局（由國(guó)家發(fā)展和改革委員會(huì)管理）

國(guó)家國(guó)防科技工業(yè)局（由工業(yè)和信息化部管理）

國(guó)家移民管理局（由公安部管理）

國(guó)家鐵路局（由交通運(yùn)輸部管理）

國(guó)家郵政局（由交通運(yùn)輸部管理）

國(guó)家中醫(yī)藥管理局（由國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)管理）

國(guó)家外匯管理局（由中國(guó)人民銀行管理）

國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局（由國(guó)家市場(chǎng)監(jiān)督管理總局管理）

國(guó)家移民管理局加掛中華人民共和國(guó)出入境管理局牌子。國(guó)家林業(yè)和草原局加掛國(guó)家公園管理局牌子。國(guó)家公務(wù)員局在中央組織部加掛牌子，由中央組織部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。國(guó)家檔案局與中央檔案館、國(guó)家保密局與中央保密委員會(huì)辦公室、國(guó)家密碼管理局與中央密碼工作領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室，一個(gè)機(jī)構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機(jī)關(guān)的下屬機(jī)構(gòu)序列。

（國(guó)務(wù)院機(jī)構(gòu)和部委管理的國(guó)家局設(shè)置信息，據(jù)國(guó)發(fā)〔2018〕6號(hào)和國(guó)發(fā)〔2018〕7號(hào)文件）^[5]