成均館大學與世界各國著名高校簽署了校際間學術交流協議，其主要合作高校包括：

中國復旦大學、哈爾濱工業大學、山東大學、吉林大學、上海交通大學、北京大學、清華大學、西安交通大學等。

美國華盛頓州立大學、普渡大學、俄亥俄州立大學、哈佛大學等。

日本名古屋大學、東京工業大學、東京大學、京都大學、早稻田大學等。

英國伯明翰大學、曼徹斯特大學、劍橋大學、牛津大學等。