拉薩海關隸屬日喀則海關位于距拉薩277公里的西藏第二大城市日喀則市，沿318國道（中尼公路）可達拉薩市、樟木口岸。主要公路路況較差，在夏季因雨水及地質關系偶爾會短暫中斷。
　　日喀則海關管轄除聶拉木縣以外的日喀則地區海關業務。管轄區南面與不丹、尼泊爾接壤，邊境線長1354公里，轄區內有吉隆口岸（對尼泊爾，國家一類口岸）、日屋口岸（對尼泊爾，國家二類口岸）,亞東監管點（亞東中印乃堆拉邊境貿易通道）。
　　日喀則海關平均海拔3836米，地形以高原為主，高原風光特征明顯。氣候為高原溫帶半干旱季風氣候，年平均溫度為攝氏6.3度，7月最熱，最高溫度可達攝氏28.2度，1月最冷，最低溫度為攝氏零下25.1度，年無霜期為168天。晝夜溫差較大。
　　日喀則海關管轄地區面積較大，進出境通道較多。該關主要以邊民互市貿易監管、邊境查私為主，近年來查獲的主要走私物品為黃金、毒品、文物、反動宣傳品和瀕危動物皮、毛、骨等。