從海關效能監管的層面來考察，聯網監管的效果十分明顯：它實現了合同為單元向企業為單元管理的轉變，使企業的生產管理與關務管理有機結合起來；實現了由靜態向動態管理的轉變，使海關能及時掌握企業加工貿易的最新動態；實現了由重單證輕實體的被動監管，向數據與實體并重的主動監管轉變，實施聯網監管企業的保稅貨物無一例外被核對“見底”；“數字對話”提高了海關執法透明度，可能發生“暗箱操作”的概率大大降低，有效化解了廉政風險。