為加強海關對加工貿易的監管，準確采集保稅企業進出口貨物數據，使前期備案與后期核銷有機地結合起來，保證核銷數據的準確、真實，杜絕假單證核銷現象，海關對保稅貨物的進出口報關進行規范是極其必要的。
　　具體要求與手續如下：
　　1.企業應符合以下條件才能到口岸海關辦理保稅貨物進出口報關手續：
　　(1)企業已申領到《登記手冊》，并在有效期內；
　　(2)接受申報的口岸海關計算機內必須有企業所持加工貿易登記手冊的計算機的備案資料；
　　(3)加工貿易登記手冊電腦備案資料應在有效期內；
　　(4)異地報關使用IC卡的，企業應申領到IC卡。
　　2.企業向海關申報保稅貨物進出口的操作流程如下：
　　報關單預錄入——審單——查驗——放行
　　3.報關前企業應準備好以下單證：
　　(1)有效的加工貿易《登記手冊》；
　　(2)已預錄入的進口或出口貨物報關單；
　　(3)海關要求的其他有關單證。
　　加工貿易進出口貨物報關單應按《中華人民共和國海關進出口貨物報關單填制規范》的要求填寫，并注意以下幾點：
　　(1)一份報關單只能填報一本《登記手冊》項下料件的進口或成品的出口，否則應分單填報；
　　(2)備案號欄應填報實際進口或出口的手冊編號；
　　(3)貿易方式欄應根據實際情況按規定選擇相應的貿易方式填報，包括來料加工（0214）、進料對口（0615）、進料非對口（0715）、三資進料加工（2215）等貿易方式；
　　(4)企業所申報進口或出口貨物的序號、品名、規格、計量單位必須與在海關備案的加工貿易登記手冊上的進口料件或出口成品的序號、品名、規格、計量單位完全一致。
　　4.報關時，加工貿易登記手冊應按以下方法填寫：進口料件的基本情況（包括進口報關日期、運輸工具名稱、貨物名稱規格、數量、價值等）填在登記手冊的“進口料件報關登記表”欄內；出口成品的基本情況（包括出口報關日期、運輸工具名稱、貨物名稱規格、數量、價值等）填在登記手冊的“出口成品登記表”欄內。
　　5.海關總署規定 5000美元以下、 78種以內客供輔料，因不核發《登記手冊》，報關時不按加工貿易方式報關，按一般貿易方式報關進出口。報關單的備案號欄填報“CXXXX0000000”，第二至五位為關區號。其他內容按《中華人民共和國海關進出口貨物報關單填制規范》填報。