（一）注冊為系統用戶。
為減少知識產權權利人申請時間和提高海關總署審核備案申請的效率，除特殊情況外，目前知識產權海關保護備案申請都應當通過“知識產權海關保護備案申請系統”提交。所以，備案申請人在提交備案申請前首先要注冊為系統用戶。系統用戶應當以知識產權權利人的名義進行注冊，填寫必要的用戶信息，以獲取系統賬號和密碼；
（二）錄入備案申請數據。
注冊用戶登錄備案申請系統后，在申請新備案窗口內填寫申請備案的知識產權和其他相關信息； 來源:報關員培訓網
（三）繳納備案費。
以銀行轉賬或電匯方式將備案費（每項備案800元）匯入海關總署賬戶，匯款時必須在備注欄內注明權利授權號或備案申請編號；
（四）提交紙面申請書。
將已錄入的備案申請數據打印成紙面申請書并加蓋申請人或代理人印章，連同備案費繳款憑據復印件和其他相關材料郵遞至海關總署的下列地址：
海關總署政策法規司知識產權保護處
北京市建國門內大街6號郵編：100730
（五）補正申請。
海關總署在收到申請人郵遞的紙面申請后才開始進行審核。但是申請人可以通過備案系統隨時了解海關總署受理、審核、核準和駁回申請的全部過程。申請人可以根據海關總署駁回申請的意見，對其申請進行補正。
（六）收到核準或者駁回申請的通知。
根據《知識產權海關保護條例》的規定，海關總署應當在自收到申請人提交的全部申請文件之日起30個工作日內將做出核準或者駁回申請的決定。海關總署核準或者駁回備案申請，都應當向申請人發出書面通知。海關總署駁回申請的，不退還原申請文件。