一、進口關稅
巴西1998年的平均關稅率為17％，對入關產品價值的確定主要依據以下五條：首先是根據成交價，即事實支付的或將支付的價格加上其他各種費用。如果這種方法被海關拒絕，那么可以采用其他4種，即相同產品的成交價；相似產品的成交價；零售價減去關稅和傭金等；或者用生產成本、利潤和其他費用計算得出。在巴西，關稅主要以CIF價計，以巴西貨幣支付。當巴西海關官員對出口商品申報的貨物價值提出質疑時，出口商有8天時間決定新的報價。進口商可以在30天之內對出口商的新報價作出反應。另外，為保護民族工業，巴西政府在進口關稅征收時主要采取以下兩種非關稅措施：1、設置最低限價或參考價，并據此征稅，此外還計征差價稅，例如，某商品的最低限價為10美元，商業發票價僅為7美元。在這種情況下，海關將對此商品以10美元的價值征稅，并征收兩種價格間的差額稅；2、對低報價或有傾銷行為的貨物征收附加稅。
二、進口單證
商業發票需5份用英文或葡文填定的商業發票。發票必須由制造商、銷售商和中間商分別用英文或葡文填定出詳細的有關裝船的情況，并附有英、葡兩種文字的產品說明書。發票還應申明產地和確切的價格。出口商可向進口商詢問是否需要出口國商業部門對貨幣價格的證明和公證材料。巴西海關對于沒有呈報商業發票的行為，其懲罰的金額將等同于關稅；當商業發票與報關單不符時，罰金將是關稅的1％～5%。
提貨單要求有5份不可轉讓的提貨單。一份附于商業發票后。所有的提貨單或貨運清單必須用數字和文字注明運費。
原產地證明一般不需要，因為商業發票上已注明產地。如果需要，則應備有兩份正式的產地證明，由商業部門證明并附有公證。
衛生許可證有些貨物如動物、動物制品、種子和植物等需要衛生證明。衛生證明首先必須經過公證，然后送交巴西使領館認證。出口商可就有關問題詢問進口商。
三、報關與入境
巴西的海關事務由財政部下屬聯邦稅務總局具體負責，包括海關政策的制定和執行、關稅的征收以及海關監管制度的實施等。根據聯邦稅務總局的海關條例，所有貨物的報關程序，均需通過巴西外貿網絡系統（siscomex）進行。貨物申報單在外貿網絡系統立案之日起即為報關程序的開始，貨物通關授權在外貿網絡系統正式通知之日起即為報送程序的結束。巴西海關根據風險分析對報關貨物實行抽檢的審查方式，即按照綠色、黃色、紅色三種不同顏色分類處理。綠色即報關貨物可全部免檢，并自動通關；黃色即僅檢查報送文件，若被核實，貨物則自動通關；紅色即報關文件和貨物均需進行檢查后方能通關。若進口貨物需申領進口許可證，進口商一般應在貨物裝船前向巴西工商旅游部外貿操作局（decom）提出申請，該進口許可證在裝船之日起60天內有效。貨物到港后90天內進口商應辦理報關手續，并將進口申報單輸入外貿網絡系統進行登記，開始報關程序。申報單的內容應按聯邦稅務總局的規定格式填寫。在巴西海關審核了一系列進口申報數據后，進口商才可提貸。根據有關規定，海關應在5個工作日之內提出驗貨結果，驗貨時當事人應在場，貨物若需樣檢，費用由當事人承擔。另外，有些特殊商品可采取提前報關制，例如散裝貨、易燃易爆和有輻射性的危險貨物、活畜、植物以及新鮮水果等易損貨物、印刷用紙張、政府部門進口的貨物、陸路、河、湖運輸的貨物。
四、自由貿易區
巴西最大的港口有桑托斯、里約熱內盧、巴拉那瓜、累西腓和維多利亞。巴西在上述口岸設立了各種形式的自由區，如自由港、自由貿易區、保稅倉庫和轉口區等。這其中最著名的是馬瑙斯自由貿易區。凡進入該區的貨物，其商業發票的提貨單上必須注明“馬瑙斯自由貿易區”（freeloneofmanaus）字樣，但不允許通過該區向巴西其他地區運送進口貨物。在該區有兩道邊關，第一道是從國外進入特區，另一道是從特區進入國內。一方面允許外國商品從國外進入特區，不受海關管制；另一方面，商品從特區進入國內市場需要辦理進口手續，貨物需經海關檢查，并交納進口關稅。