（一）外商投資企業(yè)的海關(guān)登記備案手續(xù)
　　依法批準(zhǔn)設(shè)立并已領(lǐng)取營(yíng)業(yè)執(zhí)照的外商投資企業(yè)，應(yīng)向企業(yè)所在地主管海關(guān)（企業(yè)所在地未設(shè)海關(guān)的，向管轄該地區(qū)海關(guān)業(yè)務(wù)的分管海關(guān)）辦理企業(yè)登記備案手續(xù)。登記備案時(shí)應(yīng)提供以下資料：
　　1.外經(jīng)貿(mào)部或其授權(quán)機(jī)構(gòu)簽發(fā)的外商投資企業(yè)批準(zhǔn)證書；
　　2.營(yíng)業(yè)執(zhí)照；
　　3.企業(yè)的合同章程及其有關(guān)主管部門的批準(zhǔn)文件（外資企業(yè)僅提供企業(yè)章程及其批件）；
　　4.其他有關(guān)資料（如項(xiàng)目建議書、可行性研究報(bào)告及其批復(fù)等）。
　　主管海關(guān)審核登記備案后，對(duì)資料齊全、合法、有效的，予以登記備案，發(fā)給《外商投資企業(yè)資產(chǎn)登記手冊(cè)》。
　　（二）進(jìn)出口貨物的通關(guān)手續(xù)
　　外商投資企業(yè)除辦理上述登記備案外，還應(yīng)按照海關(guān)對(duì)報(bào)關(guān)單位的規(guī)定，向主管海關(guān)辦理報(bào)關(guān)單位注冊(cè)登記手續(xù)。進(jìn)出口貨物通關(guān)的基本程序請(qǐng)參閱本節(jié)的第一部分，其中：
　　1.外商投資企業(yè)進(jìn)口屬于加工貿(mào)易項(xiàng)下的貨物，應(yīng)提供主管海關(guān)核發(fā)的《登記手冊(cè)》；外商投資企業(yè)作為投資總額內(nèi)進(jìn)口的機(jī)器設(shè)備及其零部件，應(yīng)由國(guó)家檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)辦理外商投資財(cái)產(chǎn)價(jià)值鑒定，辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)手續(xù)時(shí)，應(yīng)提供中國(guó)檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu)簽發(fā)的《外商投資財(cái)產(chǎn)價(jià)值鑒定報(bào)驗(yàn)通知單》。
　　2.外商投資企業(yè)出口屬于加工貿(mào)易項(xiàng)下加工產(chǎn)品的，應(yīng)提供主管海關(guān)核發(fā)的《登記手冊(cè)》；如屬于購買非本企業(yè)生產(chǎn)的產(chǎn)品出口的，應(yīng)提供外經(jīng)貿(mào)主管部門的批準(zhǔn)文件。
　　3.已在海關(guān)辦理了登記備案的外商投資企業(yè)，其進(jìn)口貨物如能享受國(guó)家有關(guān)減免稅優(yōu)惠政策，應(yīng)在貨物進(jìn)口前，填寫企業(yè)蓋章的免稅申請(qǐng)表，到企業(yè)所在地主管海關(guān)辦理進(jìn)口減免稅備案及審批手續(xù)。
　　(1)辦理減免稅應(yīng)向海關(guān)提供以下材料：
　　①項(xiàng)目審批部門出具的《國(guó)家鼓勵(lì)發(fā)展的外資項(xiàng)目確認(rèn)書》；
　　②項(xiàng)目主管部門審批的"企業(yè)進(jìn)口貨物清單"；
　　③有關(guān)進(jìn)口貨物的合同或發(fā)票；
　　④海關(guān)核發(fā)的《外商投資企業(yè)資產(chǎn)登記手冊(cè)》；
　　⑤其他有關(guān)材料。
　　(2)主管海關(guān)審核后，對(duì)已列入項(xiàng)目主管部門批準(zhǔn)的"企業(yè)進(jìn)口貨物清單"，符合國(guó)家對(duì)外商投資企業(yè)減免稅優(yōu)惠政策的進(jìn)口貨物，簽發(fā)《進(jìn)口貨物征免稅證明》一式兩聯(lián)，并根據(jù)有關(guān)規(guī)定批注征免稅意見后，主管海關(guān)留存第一聯(lián)，其他一聯(lián)制作關(guān)封交申請(qǐng)企業(yè)，憑以向進(jìn)境海關(guān)辦理進(jìn)口手續(xù)。
　　(3)海關(guān)簽發(fā)的《進(jìn)口貨物征免稅證明》是按一批進(jìn)口貨物、一個(gè)進(jìn)口口岸簽發(fā)的，如進(jìn)口貨物為分批到貨或分口岸進(jìn)口,則需分別申請(qǐng)辦理征免稅證明。
　　海關(guān)簽發(fā)的《進(jìn)口貨物征免稅證明》的有效期為六個(gè)月，進(jìn)口企業(yè)應(yīng)在海關(guān)簽發(fā)之日起六個(gè)月內(nèi)辦理進(jìn)口貨物手續(xù)。如因特殊情況需延長(zhǎng)期限，應(yīng)經(jīng)主管海關(guān)核準(zhǔn)。
　　對(duì)《進(jìn)口貨物征免稅證明》上海關(guān)簽署意見為"征稅"的進(jìn)口貨物，進(jìn)境地海關(guān)按規(guī)定征收進(jìn)口關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)稅后，放行貨物。對(duì)進(jìn)口貨物正在辦理但尚未辦妥《進(jìn)出口貨物征免稅證明》的，進(jìn)境地海關(guān)予以按進(jìn)口貨物應(yīng)繳納稅款征收保證金后放行貨物，企業(yè)在三個(gè)月內(nèi)補(bǔ)交《進(jìn)口貨物征免稅證明》后予以退還保證金，逾期不補(bǔ)交的，進(jìn)境海關(guān)將保證金轉(zhuǎn)為進(jìn)口稅款征收入庫。