南昌海關是國家設在江西的進出境監督管理機關，受中華人民共和國海關總署垂直領導的正局級直屬海關。主要任務是：按照《中華人民共和國海關法》和其它有關法律、法規，監管江西境內的進出境運輸工具、貨物、行李物品、郵遞物品和其它物品，征收關稅和其它稅費，查緝走私并編制海關統計和辦理其它海關業務。
　　江西省早期的海關業務一直由九江海關辦理。早在1862年，九江口岸就設有海關，后因各種原因幾經變遷。1980年4月，九江海關經國務院批準設立，并正式對外辦理業務。1988年12月1日，南昌海關正式設立，當時的辦公地點設在南昌市二七北路15號。1990年4月29日，南昌海關遷至南昌市將軍渡62號（現改為撫河中路209號）。2008年9月26日，南昌海關新業務綜合樓投入使用，南昌海關遷入現址（沿江中路100號）辦公。
　　南昌海關現下轄九江海關、贛州海關、吉安海關、景德鎮海關、新余海關和南昌海關駐高新技術產業開發區辦事處、駐龍南辦事處、駐昌北機場辦事處，駐上饒辦事處，內設辦公室、關稅處、監管通關處、審單處、綜合統計處、稽查處、緝私局（副局級）、技術處、財務處、關務保障處、人事教育處、政工辦（機關黨委）、監察審計室、現場業務處、機關服務中心、數據分中心，代管海關總署九江教育培訓基地。
　　南昌海關自成立以來，在海關總署的正確領導下，在地方黨政的關心支持下，以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，堅持“依法行政，為國把關，服務經濟，促進發展”的海關工作方針和“政治堅強，業務過硬，值得信賴”的海關隊伍建設要求，依法治稅，依法緝私，強化監管，積極推進業務改革;按照“管住自己的人，把好國家的門”的要求，加強領導班子和隊伍建設;以“江西崛起我奉獻，江西發展我作為”為己任，依法為國把關，努力服務江西崛起，服務江西省開放型經濟發展，全力促進“和諧創業、富民興贛”。近幾年，南昌海關圍繞“小關自強，爭創內陸一流海關”的目標，大力加強改革和建設，努力建設服務型、責任型和法治型海關，稅收征管連年超額完成任務，打擊走私不斷取得新成果，以通關作業改革為中心環節的各項改革全面實施，干部隊伍素質不斷提高，較好地完成了海關總署黨組交給的各項任務，關區各項工作保持了全面、協調、持續發展的良好勢頭。2009年，關區征收關稅和進口環節稅28.22億元，比2008年增長17.39%。監管進出口貨物總值59.45億美元，監管進出口貨物總量689萬噸。
　　當前，南昌海關全體關員在關黨組的帶領下，以建立現代海關制度第二步發展戰略為目標，解放思想，求真務實，開拓進取，奮發有為，按照“鞏固、發展，創新、提高”的思路闊步前進。